> Ｘネイティブのソフトって、容量がでかいわりに、
> 起動ディスクにつっこまないといけないのがおおい。

そうか?
オイラは、ほとんどを別パーテーションで運用してるんだが。

> アプリケーションとか、ホームを動かしたみたいに
> そのまま別パーテーションに移動できないのかな……

やめとけ。
シンボリックリンク使っても、絶対パスとか指定してくるアプリで、
問題が出てきたりしたから。