>>935>>941>>945
私の場合、その現象はNN3〜NC4.8時代からありました。
（環境はPM8500、KT7.5〜OS9、PPP〜ISDN〜CATV）
ちなみに>>945さんに付け加えるとするとこんな感じ↓です。

・>>945の3つの条件
・IE側は正常に動作している。
・Java Script On、キャッシュ0、どういう状況でも起こります。
・ソフトを立ち上げ直すと、現象は治る。

で、思い出したのですが、
「キャッシュ0」にしていてもcssやswfをキャッシュしないですか？
ここら辺に原因がありそうな気もするのですが・・・。