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mpegファイルをOmniWebで普通にダウソして、OS X&9.2.2でどちらでも問題なく
見れたよ。QuickTimeのバージョンは5。別にCodecとかの追加も無し。
対策としてはよく分からないが、、
・IEのファイルヘルパーの設定を見直してみる。
・ブラウザでダウソしないで、ダウンローダーを使ってみる。
・ResEditとかでmpegファイルのタイプを「MPEG」クリエイターを「TVOD」に。
くらいかなぁ。デスクトップの再構築もやってみては?