PMG4 QS 867 OS 9.2.2 です。

この前ハードディスクの中身を分割して丸ごとCDに焼いて
HD初期化→パーティションを3つに切り→データを元に戻すという作業をしました。
その時、システムフォルダとアプリケーションを入れるパーティションを別にしたんです。

で、再起動しタンですけど、はたまた何故か? ネスケが起動しない。起動画面でかたまっちまう。
しかもStuffItもおかしい。解凍しようとすると速攻でフリーズ。
更にはアップルメニューの計算機からサブメニューがでる始末......。

今あきらめて再度初期化するところですが、原因知っている方いらっしゃいます?
アプリもろとも丸ごとバックアップってのがいけなかったんでしょうか??