シャーロック２は標準設定で
「毎日0:00AM」に索引作成するにチェックが入ってるため
12時にこの現象が起こります。
IE5で12時に何か起こるというのは聞いたことがありません。
索引作成は全書類のテキスト全てはもちろん、画像ファイルの
中のテキストまで検索するので、とてつもなく時間がかかります。
検索時には隅々までできて便利ですが、特に索引作成しなくても
問題ないと思います。