＞「このディスクはこのコンピュータで読むことができません。ディスクを初期化しますか？」
＞ っていうアラートは、OSがらみなの。Aplixは関係ないのよ。

ただしいCDRWドライブ用のドライバがインストされていない場合、
生CDRを挿入するとOS側が未初期化ディスクとして認識し初期化を求めてきます。
ただしいCDRWドライブ用のドライバがインストされていれば、
OSが初期化を求める前段階でドライバが認識し、書き込みが出来るのではないでしょうか。