ありゃ、正しい仕様を勘違いしてたのは俺ですか。すんません
Javaのドキュメントにありましたか？

ディレクトリを独立したエントリにして追加した場合でも
OSXのStuffItとかunzipとかではうまくいくみたいですが、
OpenUpだとうまくいきませんでした。
ClassicのStuffItだとディレクトリを独立させなくてもだめみたいです。
未知のヘッダ形式とか言われます。原因不明

忙しいところすいませんでした。