見つけた。

● Mac OS 9.1：一般設定の項目が保存されない場合


私の家内が発見した． Mac OS 9.1 の "一般設定" コントロールパネルの
「書類」「ディスクの検証」の設定が再起動すると保存されないという現象が発生した．
外していた "Multi-User Startup" 機能拡張を戻したところ
きちんと設定が保存されるようになった．
"マルチユーザ" コントロールパネルはなくても関係ないようだ．

にぼし食えよ。