ウチのネスケ6.2ではそういった症状は出なかったよ。
ちなみにことえりでローマ字入力だが、そのへんはあんまり関係ないと
思う。自作スクリプトで文字コードとか調べても問題無かったし。
文字コードとかが間違って指定されてしまったりしていない?