> シングルCPUだと/users/ユーザー名/直下に
> 「自動的」に.sahが作られる

「シングルCPU」だからじゃなくて、shellのデフォルトが ~/ なだけ。
cd してやれば、そこが setiathome のワーキングディレクトリになります。
「シングルCPU」でもディレクトリ変えて setiathome & してやれば
複数の WU を解析できますよ。