たびたび顔出してすんません。>>25ではノートン(NIS)がバックグラウンドで
動作していたのを思い出し、この影響を調べるため機能拡張マネージャで
「Mac OS 9.0.4 基本」を選んで再挑戦しました。他の設定は25と同じです。

Total Time = 192960 ms
Preperation 77 ms
Get 1/SQRT(2) 3150 ms
Main LOOP 179262 ms
GET PI 10469 ms
GET Y 215 ms
GET A 417 ms
GET B 161969 ms
GET T 16613 ms
SQRT LOOPs 19 loop
SQRT count 342 loop(newton)

ご覧の通り約12％短縮されました。ということは、バックグラウンドで
動作するコンパネ等を常駐させてるとこれだけ遅くなるってことですね。
それにしても、>>42を見ますとGigabit EtherとDigital Audio以降との
世代の差を感じますね。