Operaとおちゅーしゃを並べてみたよ。
違わないと思うが。

http://penguin.s4.xrea.com/imgboard/img-box/img20040401165246.png

同じフォントでもfonts.dirが変われば見栄えは変わるが、同じ/X11R6/lib/X11/fontで変わるとは思えん。

ちなみにGNOME2.6+6nome。