Windowsはまともなパッケージ管理システムがないから無駄も多い
Linuxは複数の異なるアプリで使うライブラリーは/usr/lib等に入れて共有して使おうとする
Windowsは他のアプリと共有して使いにくいから各アプリで個別に同じライブラリーを持ってたりする

動画エンコードソフトだって
Linuxのやつは/usr/libにある共通ライブラリー読み込むのに
WindowsのやつはProgram Files下の各ソフトのディレクトリー下にffmpegのライブラリーがあったりするし