結論から言えばFedoraはメインOSとして常駐OSにしてしまい。
Wineを入れてWindowsアプリを動かすってのが、スマートだろう。
Windowsアプリ…代替のきく、Linux向けのアプリなんていくらでもあるから、
Wineを無理して入れる必要もないけどね。