>>28
レスありがとうございます。フォントも色々調べて試してみます。
Javaと日本語のフォントに関連性があったんですねえ。

とりあえず、起動スクリプトに「export LANG="ja_JP.UTF-8"」と追加したら文字化けなくなりました。
この方法が一般的なやり方か分からないので、ちょっと不安ですね。。