>linuxのパーテのPBRにgrubを入れて、mbrにはmbmが一番賢い。
こうやっても設定変更時にファイルシステムが読めないといけないのは変わりないが。

そもそも"mbrのローダーがパーティション内の状態に依存" するのを避ける必要がない。
どうしてもそれが嫌な人だけMBM使えばいいのであってMBM推奨とかまして一番賢いとかはありえない。