解決したかも。

KVMの起動パラメーターに -rtc base=utc,clock=host,driftfix=slew 追加したら
TvRock常駐しててもゲストの時計が遅くなっていくことが無くなった、ただしXP
のみ。
問題は俺がこのオプションの意味が分かっていないことか・・・

だんだんとズレが大きくなっていくことは無くなったけど、NTPで同期してても
手元の電波時計や実機マシンのNTP同期済み時計と比べて、必ず1〜2秒遅れてるのは謎。