プライマリ別に関係ないだろ

俺はVistaをパーティションA
UbuntuをBにいれてたけど（スワップもある）
ルートとホームをわけたいと思い、
あらたにそのままパーティションCとDを作って/とhomeでインスコしたら
GRUBにはUbuntuが２つとVistaが表示されている
設定を引き継がせたけどなんとなく現在もそのまま旧Ubuntu入ったままだ