人間のやる事だから良くしようとしてかえって悪くしてしまう事もあるのでしょうが、ため息です。
再インスコするのも小一時間ぐらいかかるし、今後バージョン（リビジョン？）があがる度に別の不具合が出るかビクビクするのなら4.Xに戻そうかとすら思います。