gentooシロウトな俺がemerge -eu systemにチャレンジしたのでメモ置いておくね
（多少記憶があいまい）
もちろん自己責任でお願いします。

#/etc/portage/package.keywords
dev-lang/python ~x86
dev-python/pygtksourceview ~x86
x11-libs/gtksourceview ~x86
sys-apps/baselayout ~x86
sys-apps/makedev ~x86
dev-libs/libpcre ~x86
他にもあったかもしれない。

これで#emerge -ue system
(途中でなんかエラー出たら自分で対処)

#etc-updateその他を行いreboot
色々設定をし直し・他にもなんかコマンド叩いた気がする
エラーでたら自分で対処

・・・肝心なとこが自分で対処ってなってるのは環境によって違うかもしれない＆
忘れてしまったw