真面目な話、Win2000/2003Serverの管理負担がハンパじゃない。
GUIのクセに使いにくいインターフェイス。不安定さ。
変なバグ。しょっちゅう見つかるセキュリティホール。
接続台数が増えるたびにCAL買い足さなけりゃなんないし。
金銭的コストもさることながら、人的コストもかかる。テスト環境にも金が掛かる。