不恰好だけどサブディレクトリまで調べて、全てのファイルにmd5sumして表示するのはこんな具合か・・・

#!/bin/sh
TMPFILE="filelist"
touch $TMPFILE
find $1 | while read FILENAME; do
if [ -f "$FILENAME" ]; then
md5sum "$FILENAME" >> $TMPFILE
fi
done
sort < $TMPFILE | uniq -D --check-chars=32
rm $TMPFILE

もうちょっとスマートにならないかなあ・・・　あとユニークなサイズのファイルはmd5sumさせたくないなあ