>Shift_JISで書いて2バイト目に ▼ が含まれるとコメントが継続しちまうかな、

sjis だろうが何だろうがコメントの継続なんてありません。

>しかし使ってよいか使わざるべきかというと、一般にスクリプトって
>どのロケールで実行されるかわからないよとかの問題が出てくる。

コメントにロケールなんて関係ありません。