>>106 本家forumにて
Gentoo 2007.0 emerge sun-jre-bin installes older gcc
http://forums.gentoo.org/viewtopic-t-565455-highlight-libstdc.html

>>105氏が示唆しているように、libstdc++-v3が問題を解決すると思われ。
まずこれを先にemergeした上で、libstdc++というvirtualパッケージをemerge、
次にお目当てのjava関連パッケージをemerge、と順序を踏めばgcc-3.*系
の芋づるを回避できるでしょう。

libstdc++というvirtualパッケージのebuildには依存についてこう記述されています。
RDEPEND="|| ( =sys-libs/libstdc++-v3-3.3* =sys-devel/gcc-3.3* )"
これは、libstdc++-v3-3.3系かもしくはgcc-3.3系、どちらかを入れてネ
という意味です。

どちらも入っていない状態では、どちらも同時に要求されてしまいます。
emergeは、入れる順序や刻み方で結果が変わってくるのです。