アプリケーションのインストールで質問させてください。

なんとかmakeまで進み、プログラムは動作するのですが
これでは/home/username/のディレクトリにファイルが展開されるだけで
うまくインストールできません。
また端末上で実行してしまうとコンソールをプログラムが使ってしまい
コマンドが撃てなくなってしまいます。
順当に進めばmake installだと思うのですがそれさえも出来ず
今後の作業工程が分からないのですが、どうすれば良いのでしょうか？