その後も色々調べた結果、initrd から initramfs に変わっていることが分かったので
そちらを調べたところ、cpio で固めていることが分かりました。
早速展開してみると、lvm関係のコマンドがまったく入っていなかったので
作り直してみようと思います。

2.4時代からずっと不具合無く動いていたので変わったことを知らずに居ました
お騒がせしてすいませんでした。