yum で kernel-devel-2.6.18-53.1.6.el5 と kernel-devel-2.6.18-53.1.13.el5 を remove してから kernel-devel を
インストールしたところ、kernel-devel はインストールできました。
しかし、vmware-config.pl で下記のエラーが出続けます。

What is the location of the directory of C header files that match your running
kernel? [/usr/src/linux/include] /usr/src/kernels/2.6.18-53.el5-i686/include

The directory of kernel headers (version 2.6.18-53.el5) does not match your
running kernel (version 2.6.18-53.1.13.el5xen). Even if the module were to
compile successfully, it would not load into the running kernel.

version 2.6.18-53.1.13.el5xen を要求しているように見えるのですが、そんなものはマシンの中に見当たりません・・・。