作者さん、乙です。要望を書いてみます。

現在のところ、Linux系に限らずオープンソース系の2chブラウザ全て、
BASIC認証をかけられたページに設置された2ch互換掲示板にアクセスできませんよね？

そこで、JDでぜひともBASIC認証に対応して頂ければと要望致します。
例えばOpenJaneのように、

外部板名
http://username:password@host/path/
path

と./jd/etc.txtに登録するとBASIC認証つきの外部板にアクセスできるとかどうでしょうか？