手元にないが、root.ext2 がext2のイメージファイルなら、
mount -r -o loop -t ext2 root.ext2 /media/root
とかでマウントして、中身をHDDにrsyncなどで書き出して
いじくる。それから
dd if=/home/lfs/root of=root.ext2
とかやって、後は残りをmkisofsでISOイメージに丸める、、、
とかだろうか。

試してないので、細かいところ外してる、はず。