ちょっとお聞きしますが、ディスクイメージをWindows上(NTFS)のファイルにしていて
以下のような症状が出ている方いませんか?

Windows上で大きなプログラム(例:JDK)のインストールorアンインストールをすると、
しばらくcolinuxが反応しなくなる。

タスクマネージャでcolinux-daemon.exeのI/Oバイト書き込み数をみると
ちょうどイメージファイルのサイズ分だけ書き込むと、かえってくるようです。

最新の0.6.2でも発生します。