ディスプレイマネージャをgdmにして、
バッチファイルから起動していたXWinをcygwinから起動させたら
GUIログインできました。
ありがとうございました > ALL

でも異様に遅いですね。
xterm 立ち上げるだけで4〜5秒かかるんですけどこんなもの？
苦労の割にちょっとがっかり・・