成果物が何なのかよくわからんけど、

> bash-2.05$ cvd88 GR-DOS.HDM Documents/GR-DOS.D88
っコマンド打った場所に、”GR-DOS.HDM”があるの？
"pwd"で自分のいるとこ確認して、"ls -a"でファイルあるか確認して、
なければ、"find / -name GR-DOS.HDM"でファイルの在りか探して、
その場所に移動して、もう一度試してみたらどうかな？

> bash-2.05$ lha e Documents/grdoshdm.lzh
って打ってるとこみると、Documentsに移動しないど駄目なんじゃないかな？