地域猫には保健所は何もしてくれませんよ。

人に害をなすなら警察か市役所。
死体になっているなら市役所(ゴミとして)。
それ以外の場合は保護されています。
伝染病の媒介者などとして認定されれば保健所も動いてくれますが
現在そのような状況下にはありません。