入れ替えは無理でしょう。
今のトーナメントが決勝まで終わって尚且つ第２回が開催されるようなら
その時提案してください。

本トーナメントと絡ませないでやる分には一向に構いません。
１回戦終了と同時にやりましょう。
敗者全員128名を集めて一斉にバトルロイヤル方式で投票。一人何票でもOK。
いちばん得票数の多かったキャラを「破壊女王」として認定。

こんなもんでどうでしょうか？