自分あんまり詳しくないんですけど。フレッツISDNでアルファだったんですが、
ちゃんとftp鯖立てられましたよ。

windows2000のCDいれて、IISインストールして。セキュリティーとか面倒なんですよねぇ。
コンピュータへの管理→インターネットインフォメーション→規定のFTPサイト
をいろいろといじってみたらできたよ。