ユーザー目線だけで見ると…

MAP-Eは後発規格(相対的に互換性低？要検証)
ユーザー側のルーターへの負荷が高い
ポート開放は限定的ながら可能
HGWが対応している

DS-Liteは先行規格(海外でも普及中 互換性高？)
業者側の機器への負荷が高い
ポート開放は不可能
HGWは対応していない