>>522です。結果報告です。
フレッツの担当の方が電話で丁寧に対応してくれました。
パソコンはギガ対応の有線LANじゃないので、フレッツの測定サイトでも91Mbpsくらいでした。
担当の方の指示通り、無線ルータに繋いで、iPhone6sでフレッツの測定サイトに接続したところ、260Mbps出ました。

以上より、ONUや無線ルータは速度が出るので問題なし。プロバイダやその他の条件で、速度が100Mbps以下になっているのでしょう、とのことでした。
以下は私見ですが、100Mbpsをギリギリ下回る速度だったので、頭打ちになっている気がして、回線や機械を疑っていましたが、どうやらプロバイダが原因ではないかと思います。ちなみにOCNです。