自己解決しました。
早い話が学割や端末代金の月割で既に割引対象の基本料金が3620円しか残っていないということのようです。
しかしスマホ購入時も、店頭でのひかりお得割申し込み時も5200円割引されると説明を受けているのでサポートからの返答があったら強く交渉しようと思います。
高額月割の機種でスマホプランSの人はお気を付けください。