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漏れも同じ症状でなやんだことがあります。
win2000とかはMTUなんかは自動で最適化してるので、実はいじる必要なし。(一般的に。勝手にレジストリで
指定されてるってひとは知らんけど。)

ルータはRta54。

ルータでMTUの値をいじってない?
パソコンから出てるパケットをルータがまたごそごそすると、パケットサイズやフラグメンテーション
がうまくいかなくて、特定のサイトにいけないという症状がでました。

とりあえず、OS、ルータ共に自動にしてみては?

または強制的にMTUを小さくする。そうすればいけるかも。

用は家を出た後のルーティング経路で通過できてないんだよ。