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なんかこの板より、通信技術板の方がよさそうな...

ふむ、名前解決は大丈夫っぽいけど。
「Duplicate Ack」って、やっぱり先方のルータがおかしくないですか。
MTUサイズの指定理由も気になるけど、TCPでそれが出てるってことは
フラグメントした場合、パケットがロストしてるらしいってことでしょう。
UDP/ICMPならともかく、TCPで出てしまうってことは、

　ttp://homepage2.nifty.com/oso/optrwin/drtcp.html

これの5が機能してないとか、そういう話になる。

　ttp://www.soi.wide.ad.jp/class/20040021/slides/10/23.html

原因追求となると経路上の設定を一通り調べないとならないが、
特定のサイトが駄目ってことは、やはり先方の事情じゃないかと。