皆様、先日はいろいろありがとうございました。

結局、常駐ソフトを全部アンインストールしたうえで、修整パッチあてて変更してみても1320で変わりませんでした。
そこで、再度その旨を含めた上でキンデンに質問したところ、以下の回答を得て一応解決しました。
ただ、ちょっと信じられない回答だったので、皆様に判断して頂きたいとおもいます。

スピードガイドのTCPアナライザーですとどのような値を入れても変わらない
現象が発生しています(弊社でも確認済み)
#####はBフレッツを引いておりますのでMTU1454で大丈夫
かと思います。もちろんTCPアナライザーで表示されるMTU値でも問題は
発生しません。(こちらで両方試しましたが特に速度に変化はありません
でした)

とのことでした。ありえる話でしょうか?信じていいでしょうか?