いいですかぁ？
基本的に移民宇宙船は内部で自己完結した循環システムがあるはずです。
さらに想定されるトラブルに対応できる技術者と、予備の物資
さらにはメンテナンス出来る船内構造と宇宙服などががあるはずです。
それが無ければ人類は馬鹿です。

もしも酸素や水の総量が減ってしまった場合、予備の物資でも足りない場合は
燃料から水素と酸素を頂きます。

基本的に移民宇宙船は大型船のはずです。つまり加速するのにとても時間がかかる。
同じく減速するのにもとても時間が掛かる。基本的には計算し尽くした慣性移動で
航行しているはずなのです。予備の針路変更のためにある燃料を使います。