多分、タグのトラック名にはちゃんと入ってるはずなので、
こんなのを使ってまとめてファイル名を変えてしまうのがいいかも
http://www.forest.impress.co.jp/article/2006/05/10/step.html

同種のタグエディターは多数あるので好きなものをどうぞ。