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バッハの無伴奏チェロ組曲の楽譜自体は、著作権消滅していますので、チェロの楽譜から自分でギター用に編曲して演奏する分には大丈夫。
しかし、ギター用に編曲された楽譜を使用する場合には、編曲者の著作権が発生する可能性があります。
また、無料で営利目的でなければ、ＣＤ作成は問題ないが、同人ＣＤであっても有料であったり、無料でも営利目的（商品のおまけ、宣伝用）ならば、編曲者の権利が発生するようです。