調によって違う色調で聞える具体的な原因を探りましょうよ。

例えば、弦ではヴァイオリンの調弦がGDAE、ヴィオラ・チェロがCGDAなので、
シャープ系の調でより多くの共鳴が得られて明るく響きます。
(低い弦(G線など)が多く共鳴するとより広大なイメージに聴こえる)
フラット系は共鳴が無いのに加え、左指の形も不自然なため音程もちょっと取り辛いです。
渋めに聞えるのはそれが原因かも知れません。

管や鍵盤の情報もあれば教えてください。
平均率で調律されたピアノでは音の高さだけしか変わらないけど、
何々法で調律すると何調で長三度が広くなるとか狭くなるとか…そんな情報ありますか?