アーノンクールがどう言ったかの正確な引用がないから、
彼の発言とは関係ないということでいい？

可能な限り「自筆に近い」ものを参照する、っていうスタンスはあるんじゃなかろうか。
それが原典版（第三者の校訂したもの）なのか、
校訂の材料にした楽譜類なのか、は別の話だと思われ