>「シグマズームのレンズ全体での透過率」
>「カメラに伝わる開放F値と本当のF値の差」
>これって実質的に同じことでしょ。

違うんだな。
前者はT値とF値の差異の問題で、後者は、
「あとズーミングしたときの変動の傾向と」の話。

それから、

>開放測光なんだから測光値が
>例えば1/3段オーバーだ、とか把握してればOKなんじゃない?

だから、そのカメラ自身においては問題無いって。
問題は、それを他のカメラに適用すること。

もうちょっと勉強しろよ。