あくまで一般的にですが、それほどガチガチではなく
統計のツールとして名前がよく出るものはほぼOKと考えて
問題ないですよ。
また、サブルーチン的なツールも使われたりもしてます。
ローカルなものは避けた方がいいという感じでしょうか。

なお一般的というのは、分野によっては違うでしょうし
分野特有のツールもあるから。

近頃は分析手法というより一つの流れとしての分析が要求
されることもあるようですよ。ただ、その辺の情報は離れて
久しいので、詳しくない。