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酵母に乳酸菌が繁殖しているのはいい事です。
 (酒造りでも速醸系(一般的な酒造り)の場合、ph調整で乳酸を添加します。)

私が思うにイースト菌が酵母に繁殖していない→発酵に時間がかかる
→酢酸菌など嫌気性の菌が繁殖→酸っぱいパンになっている気がします。

発酵液、酵母そしてパンも発酵させすぎると酸っぱくなる(市販のイーストを使っても)
ので気を付けましょう。

酵母パンは酵母の香り味がパンになると思います。
発酵液、酵母は発酵させた後、味見してみるとイイと思います。
(食べてもいいけど気になるなら吐き出してネ)

何にしても良い酵母を作れるといいですね!がんばれ