>>190
直接的にはX線解析、もうちょっと断片的だけどこういった原子の繋がりがあるってのは
核磁気共鳴や分光法で分かる。
つまり目で見えなくても電磁波で見たら構造ごとに固有の反応がある。

それ以外にも燃やした時に出るガスからどんな原子の組成比だとか色々調べたり。

「基」自体は、同じ「基」を持ってたら化学反応で似たような挙動を示したり、
同じような材料から合成できたりって意味で都合いいからって便宜的にグループ分けしたもの。